Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL4AQ13619 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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