Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC63Q05C16 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC63Q05C16 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms