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Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
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256 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
TKL1
YPR074C
2043 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
MRF1
YGL143C
1242 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
SPL2
YHR136C
447 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
PEP8
YJL053W
1140 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YKR011C
YKR011C
1062 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
GIM5
YML094W
492 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
MRPL3
YMR024W
1173 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
PRX1
YBL064C
786 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
TSR4
YOL022C
1227 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ATX2
YOR079C
942 nt
4.81
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
TRM11
YOL124C
1302 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YDR199W
YDR199W
366 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YEL053W-A
YEL053W-A
348 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
NSG1
YHR133C
876 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
EAF6
YJR082C
342 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
COX17
YLL009C
210 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
SCW10
YMR305C
1170 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ISU2
YOR226C
471 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
RFC5
YBR087W
1065 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
POL30
YBR088C
777 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
HAP1
YLR256W
4509 nt
4.8
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ASM4
YDL088C
1587 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
MET17
YLR303W
1335 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
CRZ1
YNL027W
2037 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
PHO13
YDL236W
939 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
UBC13
YDR092W
462 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YER006C-A
YER006C-A
318 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
CDC12
YHR107C
1224 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ILM1
YJR118C
612 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YLR400W
YLR400W
474 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YBR012C
YBR012C
420 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YBR016W
YBR016W
387 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FMP23
YBR047W
528 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
RPB5
YBR154C
648 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FUI1
YBL042C
1920 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YEL077C
YEL077C
3834 nt
4.79
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
PDI1
YCL043C
1569 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
SPC97
YHR172W
2472 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FAT3
YKL187C
2253 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
UGA2
YBR006W
1494 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YDL032W
YDL032W
312 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ARO2
YGL148W
1131 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YIL161W
YIL161W
708 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YJR087W
YJR087W
351 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FUN19
YAL034C
1242 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YMR193C-A
YMR193C-A
387 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YNL035C
YNL035C
1170 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
RHO5
YNL180C
996 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
CDC21
YOR074C
915 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FEX1
YOR390W
1128 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
LEE1
YPL054W
906 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FEX2
YPL279C
1128 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
MET7
YOR241W
1647 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
SER33
YIL074C
1410 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
FAR10
YLR238W
1437 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
YML020W
YML020W
1995 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
MPP10
YJR002W
1782 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
TDA3
YHR009C
1572 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
NTA1
YJR062C
1374 nt
4.78
□□□□□ -1.64
ROT1
Q03691
ALG2
YGL065C
1512 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MCM6
YGL201C
3054 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
OCT1
YKL134C
2319 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YAL034C-B
YAL034C-B
354 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
RPC37
YKR025W
849 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MRPL44
YMR225C
297 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
ECM23
YPL021W
564 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YPL077C
YPL077C
723 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YSY6
YBR162W-A
198 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
SST2
YLR452C
2097 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
DSE1
YER124C
1722 nt
4.77
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
ZUO1
YGR285C
1302 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MKS1
YNL076W
1755 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
BZZ1
YHR114W
1902 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YGR018C
YGR018C
330 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
CAB4
YGR277C
918 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
VPS29
YHR012W
849 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YAL044W-A
YAL044W-A
333 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
ACP1
YKL192C
378 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
RHO4
YKR055W
876 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YML057C-A
YML057C-A
390 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
RRN7
YJL025W
1545 nt
4.76
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
CCZ1
YBR131W
2115 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
CTK1
YKL139W
1587 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
ERG4
YGL012W
1422 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
UBC8
YEL012W
657 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MIG3
YER028C
1185 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MIG2
YGL209W
1149 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YGR161W-C
YGR161W-C
279 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YHR213W
YHR213W
597 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YIL068W-A
YIL068W-A
384 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YJL133C-A
YJL133C-A
225 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
YAR062W
YAR062W
597 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MOH1
YBL049W
417 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
CSM4
YPL200W
471 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MMT1
YMR177W
1533 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
RAD30
YDR419W
1899 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
MMT2
YPL224C
1455 nt
4.75
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
SLF1
YDR515W
1344 nt
4.74
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
RBA50
YDR527W
1320 nt
4.74
□□□□□ -1.65
ROT1
Q03691
CUE2
YKL090W
1332 nt
4.74
□□□□□ -1.65
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