Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAX2Q02962 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms