Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2C1P98194 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2C1P98194 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2C1P98194 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms