Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCE1P61221 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCE1P61221 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCE1P61221 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCE1P61221 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCE1P61221 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms