Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms