Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH5P33151 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH5P33151 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH5P33151 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH5P33151 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH5P33151 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH5P33151 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.4 ms