Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEFLP07196 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEFLP07196 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEFLP07196 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFLP07196 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFLP07196 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEFLP07196 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEFLP07196 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEFLP07196 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEFLP07196 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFLP07196 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFLP07196 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms