Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB3P05106 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms