Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TK1P04183 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TK1P04183 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TK1P04183 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TK1P04183 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TK1P04183 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms