Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms