Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGA8Q9Y5G5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHGA8Q9Y5G5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms