Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZDHHC3Q9NYG2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms