Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4BQ9NT99 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC4BQ9NT99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms