Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC3Q9BY71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms