Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPCDR1Q9BY65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPCDR1Q9BY65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms