Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC106Q9BWC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC106Q9BWC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms