Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM42Q9BTD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM42Q9BTD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms