Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms