Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD8Q96LT4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SAMD8Q96LT4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD8Q96LT4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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