Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC47Q96A33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC47Q96A33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms