Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE23Q8NDY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE23Q8NDY6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms