Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE3Q8IX30 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE3Q8IX30 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms