Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL19A1Q14993 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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