Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTAN1Q13813 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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