Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBA1Q02410 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA1Q02410 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APBA1Q02410 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms