Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00205P59089 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms