Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC24CP53992 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms