Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCAN1P53805 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms