Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	IME4	YGL192W	1803 nt		3.54	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	HOS3	YPL116W	2094 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RPS8B	YER102W	603 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	MFA2	YNL145W	117 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	LTO1	YNL260C	597 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	WRS1	YOL097C	1299 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	TAF7	YMR227C	1773 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	APP1	YNL094W	1764 nt		3.53	□□□□□ -1.84
ATG12	P38316	VPS30	YPL120W	1674 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ATP5	YDR298C	639 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YGL214W	YGL214W	486 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	AAD10	YJR155W	867 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YGK3	YOL128C	1128 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MIF2	YKL089W	1650 nt		3.52	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	OSH2	YDL019C	3852 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	PRR2	YDL214C	2100 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	DOS2	YDR068W	933 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SPI1	YER150W	447 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	WSS1	YHR134W	810 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MPD1	YOR288C	957 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	IDI1	YPL117C	867 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.51	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	BUD30	YDL151C	582 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	BMH1	YER177W	804 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	PEX12	YMR026C	1200 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YAR1	YPL239W	603 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.5	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SPS2	YDR522C	1509 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ROK1	YGL171W	1695 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	VAC17	YCL063W	1272 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YDR249C	YDR249C	1122 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YLR462W	YLR462W	609 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SHH3	YMR118C	591 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MCK1	YNL307C	1128 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	RTK1	YDL025C	1863 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	PUS9	YDL036C	1389 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YLR345W	YLR345W	1530 nt		3.49	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	GLO3	YER122C	1482 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YCL075W	YCL075W	441 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	OPI6	YDL096C	327 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	COS12	YGL263W	1143 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YHB1	YGR234W	1200 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	SRP40	YKR092C	1221 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YLR326W	YLR326W	723 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ERD2	YBL040C	660 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YPT53	YNL093W	663 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	TIR2	YOR010C	756 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YMR1	YJR110W	2067 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.48	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	GRS2	YPR081C	1857 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YGL188C	YGL188C	174 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	AGE2	YIL044C	897 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ANB1	YJR047C	474 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	PAM18	YLR008C	507 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	VTA1	YLR181C	993 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YIM2	YMR151W	438 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.47	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	ALO1	YML086C	1581 nt		3.46	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	URA2	YJL130C	6645 nt		3.46	□□□□□ -1.85
ATG12	P38316	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	TGL1	YKL140W	1647 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	PCL9	YDL179W	915 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SPO73	YER046W	432 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	EMG1	YLR186W	759 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YET2	YMR040W	483 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YHL012W	YHL012W	1482 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	BUD6	YLR319C	2367 nt		3.46	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	TCO89	YPL180W	2400 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	MDM38	YOL027C	1722 nt		3.45	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms