Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP6P35125 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP6P35125 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP6P35125 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP6P35125 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP6P35125 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP6P35125 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP6P35125 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP6P35125 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP6P35125 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP6P35125 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
USP6P35125 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP6P35125 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP6P35125 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
USP6P35125 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP6P35125 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP6P35125 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP6P35125 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP6P35125 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP6P35125 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP6P35125 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
USP6P35125 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP6P35125 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP6P35125 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP6P35125 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP6P35125 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP6P35125 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms