Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO2P25791 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO2P25791 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMO2P25791 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO2P25791 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO2P25791 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO2P25791 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO2P25791 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMO2P25791 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO2P25791 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms