Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF2P04141 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSF2P04141 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSF2P04141 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF2P04141 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2P04141 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2P04141 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2P04141 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF2P04141 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF2P04141 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF2P04141 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF2P04141 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF2P04141 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF2P04141 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms