Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM4AO75164 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM4AO75164 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms