Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCRIPO60506 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms