Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN9O14815 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN9O14815 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN9O14815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms