Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3KRW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3KRW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3KRW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
J3KRW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
J3KRW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3KRW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3KRW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3KRW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
J3KRW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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