Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPIPA5E9PKD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPA5E9PKD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms