Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHMG1C9JSJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHMG1C9JSJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms