Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN16Q9Y5I7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN16Q9Y5I7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms