Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX4Q9Y2E6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms