Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCOR1Q9UKL0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCOR1Q9UKL0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCOR1Q9UKL0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCOR1Q9UKL0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCOR1Q9UKL0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms