Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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