Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK13-1Q9NX77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms