Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BATF3Q9NR55 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BATF3Q9NR55 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms