Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASS4Q9NQ75 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASS4Q9NQ75 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms