Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms