Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC3Q9BY71 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC3Q9BY71 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC3Q9BY71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms