Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFHD1Q9BUP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFHD1Q9BUP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms